Import a c3d file using the C++ ezc3d library.
Details
This function reads a c3d file with biomechanical data. It returns a c3d object, which is a list of all imported data.
The resulting c3d object has the following entries:
header: A list with header parameters containing general meta data for the recording.
nframesis the total number of frames recorded.npointsis the total number of points recorded.nanalogsis the number of analog channels.analogperframeis the rate of analog frames per point recording frame.framerateis the number of point frames per second.neventsis the number of recorded events.parameters: A list with meta data of the recording. The parameters are organized in groups, similarly to the original structure in the c3d file.
data: A list with the point data of the recording. Each element in the list corresponds to one frame. Use
c3d_data()to convert the data to a data frame.analog: A list with the analog data of the recording. Each element of the list corresponds to one frame of the point recording and contains a matrix with all analog channels (as columns) for all subframes (as rows). Use
c3d_analog()to convert the data to a data frame.forceplatform: A list with force platform data, if available. Each element in the list corresponds to one force platform. Each force platform is another list with the following elements:
forcesis a matrix of the forces.momentsis a matrix of the moments.tzis a matrix of the moments on the center of pressure.metais a list with further meta data of the force platform recording (frames,funitunit of force,munitunit of moments,punitunit of center of pressure position,calmatrixcalibration matrix,cornersposition of the corners,originposition of the origin).
Examples
# get example data path
path <- c3d_example()
d <- c3d_read(path)
str(d)
#> List of 6
#> $ header :List of 6
#> ..$ nframes : int 340
#> ..$ npoints : int 55
#> ..$ nanalogs : int 69
#> ..$ analogperframe: int 10
#> ..$ framerate : num 200
#> ..$ nevents : num 0
#> $ parameters :List of 7
#> ..$ POINT :List of 12
#> .. ..$ USED : int 55
#> .. ..$ SCALE : num -0.0762
#> .. ..$ RATE : num 200
#> .. ..$ DATA_START : int 29
#> .. ..$ FRAMES : int 340
#> .. ..$ LABELS : chr [1:55] "L_IAS" "L_IPS" "R_IPS" "R_IAS" ...
#> .. ..$ DESCRIPTIONS : chr [1:55] "L_IAS" "L_IPS" "R_IPS" "R_IAS" ...
#> .. ..$ UNITS : chr "mm"
#> .. ..$ LONG_FRAMES : num 340
#> .. ..$ Y_SCREEN : chr "-Z"
#> .. ..$ X_SCREEN : chr "-X"
#> .. ..$ ORIGINAL_LAST_FRAME: num 1631
#> ..$ ANALOG :List of 10
#> .. ..$ USED : int 69
#> .. ..$ LABELS : chr [1:69] "FP1_FX" "FP1_FY" "FP1_FZ" "FP1_MX" ...
#> .. ..$ DESCRIPTIONS: chr [1:69] "FP1_FX" "FP1_FY" "FP1_FZ" "FP1_MX" ...
#> .. ..$ GEN_SCALE : num 1
#> .. ..$ SCALE : num [1:69] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
#> .. ..$ OFFSET : int [1:69] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
#> .. ..$ UNITS : chr [1:69] "V" "V" "V" "V" ...
#> .. ..$ RATE : num 2000
#> .. ..$ FORMAT : chr(0)
#> .. ..$ BITS : int(0)
#> ..$ SEG :List of 5
#> .. ..$ PRED_ERROR : num 30
#> .. ..$ MAX_RESID : num 10
#> .. ..$ ACC_FACTOR : num 50000
#> .. ..$ NOISE_FACTOR: num 10
#> .. ..$ DATA_LIMITS : num [1:6] -605.92 -124.87 8.07 2439.43 526.84 ...
#> ..$ MANUFACTURER :List of 3
#> .. ..$ COMPANY : chr "Qualisys"
#> .. ..$ SOFTWARE: chr "Qualisys Track Manager"
#> .. ..$ VERSION : int [1:3] 2 17 3720
#> ..$ FORCE_PLATFORM:List of 8
#> .. ..$ USED : int 2
#> .. ..$ TYPE : int [1:2] 2 2
#> .. ..$ ZERO : int [1:2] 0 0
#> .. ..$ CORNERS : num [1:24] 508 464 0 508 0 ...
#> .. ..$ ORIGIN : num [1:6] -1.524 0.762 34.036 -1.016 0 ...
#> .. ..$ CHANNEL : int [1:12] 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 ...
#> .. ..$ CAL_MATRIX : num [1:72] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
#> .. ..$ MATRIX_STORE: chr "BYCOLUMN"
#> ..$ EVENT :List of 3
#> .. ..$ USED : int 7
#> .. ..$ LABELS: chr [1:7] "LHS" "RTO" "RHS" "LTO" ...
#> .. ..$ TIMES : num [1:14] 0 3.59 0 3.68 0 ...
#> ..$ PROCESSING :List of 4
#> .. ..$ Uncropped Measurement Length : num 8.15
#> .. ..$ Uncropped Measurement Frames : num 1631
#> .. ..$ Cropped Measurement Start Frame: num 705
#> .. ..$ Cropped Measurement End Frame : num 1044
#> $ data :List of 340
#> ..$ :List of 55
#> .. ..$ : num [1:3] -220 306 846
#> .. ..$ : num [1:3] -398 237 873
#> .. ..$ : num [1:3] -393 146 880
#> .. ..$ : num [1:3] -221 64.7 844.9
#> .. ..$ : num [1:3] -217 202 1269
#> .. ..$ : num [1:3] -184 206 1120
#> .. ..$ : num [1:3] -411 182 1137
#> .. ..$ : num [1:3] -349 190 1355
#> .. ..$ : num [1:3] -395.8 60.8 1196.9
#> .. ..$ : num [1:3] -165 231 1442
#> .. ..$ : num [1:3] -235 269 1455
#> .. ..$ : num [1:3] -227 120 1451
#> .. ..$ : num [1:3] -160 168 1440
#> .. ..$ : num [1:3] -264 367 752
#> .. ..$ : num [1:3] -181 372 554
#> .. ..$ : num [1:3] -134 350 449
#> .. ..$ : num [1:3] -107 239 436
#> .. ..$ : num [1:3] -122 357 381
#> .. ..$ : num [1:3] -59.1 314.2 382.3
#> .. ..$ : num [1:3] -96 368 274
#> .. ..$ : num [1:3] -10.6 335.4 76.5
#> .. ..$ : num [1:3] 10.4 258.7 108.8
#> .. ..$ : num [1:3] -32 282.1 23.6
#> .. ..$ : num [1:3] 135 291 106
#> .. ..$ : num [1:3] 97.9 368.1 77.4
#> .. ..$ : num [1:3] -297.7 11.4 754.4
#> .. ..$ : num [1:3] -316.4 19.9 627.8
#> .. ..$ : num [1:3] -392.5 62.3 432.3
#> .. ..$ : num [1:3] -386 168 420
#> .. ..$ : num [1:3] -441.2 58.4 376.7
#> .. ..$ : num [1:3] -383 105 352
#> .. ..$ : num [1:3] -513.4 84.3 197
#> .. ..$ : num [1:3] -554.6 113.3 78.5
#> .. ..$ : num [1:3] -517.2 193 89.4
#> .. ..$ : num [1:3] -605.9 167 50.5
#> .. ..$ : num [1:3] -415.5 162.2 24.4
#> .. ..$ : num [1:3] -467.8 71.1 19.2
#> .. ..$ : num [1:3] -458 495 728
#> .. ..$ : num [1:3] -378 454 688
#> .. ..$ : num [1:3] -421 496 802
#> .. ..$ : num [1:3] -372 441 785
#> .. ..$ : num [1:3] -378 479 928
#> .. ..$ : num [1:3] -386 448 1017
#> .. ..$ : num [1:3] -408 369 996
#> .. ..$ : num [1:3] -360 434 1109
#> .. ..$ : num [1:3] -52.6 -105.7 767.5
#> .. ..$ : num [1:3] 18.1 -41.3 797.4
#> .. ..$ : num [1:3] -82.5 -106.5 839.4
#> .. ..$ : num [1:3] -54.9 -34.9 851.7
#> .. ..$ : num [1:3] -119.9 -98.7 910
#> .. ..$ : num [1:3] -224.3 -86.4 1016.9
#> .. ..$ : num [1:3] -259.3 -17.1 977.3
#> .. ..$ : num [1:3] -233.7 -51.3 1130.6
#> .. ..$ : num [1:3] -308 370 1294
#> .. ..$ : num [1:3] -255.6 18.7 1295.2
#> ..$ :List of 55
#> .. ..$ : num [1:3] -212 307 845
#> .. ..$ : num [1:3] -391 238 871
#> .. ..$ : num [1:3] -386 147 879
#> .. ..$ : num [1:3] -214 65 844
#> .. ..$ : num [1:3] -209 203 1268
#> .. ..$ : num [1:3] -177 207 1118
#> .. ..$ : num [1:3] -404 182 1136
#> .. ..$ : num [1:3] -341 191 1353
#> .. ..$ : num [1:3] -388.4 61.5 1195.7
#> .. ..$ : num [1:3] -158 231 1440
#> .. ..$ : num [1:3] -227 270 1453
#> .. ..$ : num [1:3] -219 121 1450
#> .. ..$ : num [1:3] -153 169 1438
#> .. ..$ : num [1:3] -257 368 750
#> .. ..$ : num [1:3] -176 373 552
#> .. ..$ : num [1:3] -128 350 447
#> .. ..$ : num [1:3] -101 238 434
#> .. ..$ : num [1:3] -113 357 381
#> .. ..$ : num [1:3] -50.4 314.4 382.7
#> .. ..$ : num [1:3] -84.6 368.9 273.9
#> .. ..$ : num [1:3] 5.03 335.68 77.85
#> .. ..$ : num [1:3] 25.1 259 110.8
#> .. ..$ : num [1:3] -15.5 282.5 24.4
#> .. ..$ : num [1:3] 150 290 111
#> .. ..$ : num [1:3] 114 367.5 80.9
#> .. ..$ : num [1:3] -291.3 11.7 753.4
#> .. ..$ : num [1:3] -310.8 19.4 627
#> .. ..$ : num [1:3] -388.3 62.2 432
#> .. ..$ : num [1:3] -382 168 420
#> .. ..$ : num [1:3] -437.4 58.3 376.9
#> .. ..$ : num [1:3] -379 104 351
#> .. ..$ : num [1:3] -512 84 198
#> .. ..$ : num [1:3] -554 112.9 79.9
#> .. ..$ : num [1:3] -517.5 193 89.4
#> .. ..$ : num [1:3] -605.7 166.5 52.4
#> .. ..$ : num [1:3] -416 162.1 23.9
#> .. ..$ : num [1:3] -467.8 71 19.2
#> .. ..$ : num [1:3] -454 496 728
#> .. ..$ : num [1:3] -374 455 687
#> .. ..$ : num [1:3] -416 496 801
#> .. ..$ : num [1:3] -367 442 783
#> .. ..$ : num [1:3] -372 480 926
#> .. ..$ : num [1:3] -380 449 1016
#> .. ..$ : num [1:3] -401 369 995
#> .. ..$ : num [1:3] -353 434 1107
#> .. ..$ : num [1:3] -41.2 -104.3 768.5
#> .. ..$ : num [1:3] 29 -40.1 799.9
#> .. ..$ : num [1:3] -72.2 -105.4 839.6
#> .. ..$ : num [1:3] -44.6 -33.9 853
#> .. ..$ : num [1:3] -110.5 -97.9 910.3
#> .. ..$ : num [1:3] -216.2 -85.9 1015.9
#> .. ..$ : num [1:3] -250.7 -16.7 975.9
#> .. ..$ : num [1:3] -225.9 -50.6 1129.6
#> .. ..$ : num [1:3] -301 370 1293
#> .. ..$ : num [1:3] -248.1 19.7 1293.8
#> ..$ :List of 55
#> .. ..$ : num [1:3] -205 307 843
#> .. ..$ : num [1:3] -383 239 870
#> .. ..$ : num [1:3] -378 148 878
#> .. ..$ : num [1:3] -206.1 65.3 842.5
#> .. ..$ : num [1:3] -202 203 1266
#> .. ..$ : num [1:3] -169 207 1117
#> .. ..$ : num [1:3] -396 183 1135
#> .. ..$ : num [1:3] -334 192 1352
#> .. ..$ : num [1:3] -381 62.3 1194.5
#> .. ..$ : num [1:3] -150 232 1439
#> .. ..$ : num [1:3] -220 271 1452
#> .. ..$ : num [1:3] -212 122 1448
#> .. ..$ : num [1:3] -145 170 1437
#> .. ..$ : num [1:3] -250 368 749
#> .. ..$ : num [1:3] -170 374 550
#> .. ..$ : num [1:3] -121 350 446
#> .. ..$ : num [1:3] -93.7 237.4 432.2
#> .. ..$ : num [1:3] -105 357 380
#> .. ..$ : num [1:3] -41.7 314.6 383
#> .. ..$ : num [1:3] -73.6 369.2 273.6
#> .. ..$ : num [1:3] 19.7 336 79.2
#> .. ..$ : num [1:3] 38.9 259.3 112.5
#> .. ..$ : num [1:3] 0.0601 282.8171 25.3846
#> .. ..$ : num [1:3] 164 289 115
#> .. ..$ : num [1:3] 129.2 366.9 83.9
#> .. ..$ : num [1:3] -284.8 11.9 752.5
#> .. ..$ : num [1:3] -305.1 19.1 626.2
#> .. ..$ : num [1:3] -383.8 62.1 431.7
#> .. ..$ : num [1:3] -378 168 419
#> .. ..$ : num [1:3] -433.4 58.2 377.2
#> .. ..$ : num [1:3] -376 104 351
#> .. ..$ : num [1:3] -509.5 83.7 199
#> .. ..$ : num [1:3] -553.3 112.4 81.2
#> .. ..$ : num [1:3] -516.2 192.3 90.7
#> .. ..$ : num [1:3] -605.4 165.9 54.4
#> .. ..$ : num [1:3] -416.1 162 23.9
#> .. ..$ : num [1:3] -467.7 71 19.2
#> .. ..$ : num [1:3] -450 496 727
#> .. ..$ : num [1:3] -370 456 685
#> .. ..$ : num [1:3] -411 497 800
#> .. ..$ : num [1:3] -362 443 782
#> .. ..$ : num [1:3] -367 480 925
#> .. ..$ : num [1:3] -373 449 1015
#> .. ..$ : num [1:3] -394 370 993
#> .. ..$ : num [1:3] -347 435 1106
#> .. ..$ : num [1:3] -30 -103 770
#> .. ..$ : num [1:3] 39.8 -39 802.4
#> .. ..$ : num [1:3] -62.1 -104.4 840.3
#> .. ..$ : num [1:3] -34.6 -32.9 854.3
#> .. ..$ : num [1:3] -101.3 -97.1 910.3
#> .. ..$ : num [1:3] -208 -85.4 1014.9
#> .. ..$ : num [1:3] -242.2 -16.1 974.6
#> .. ..$ : num [1:3] -218.1 -49.8 1128.6
#> .. ..$ : num [1:3] -294 371 1291
#> .. ..$ : num [1:3] -240.7 20.6 1292.5
#> ..$ :List of 55
#> .. ..$ : num [1:3] -197 307 842
#> .. ..$ : num [1:3] -376 240 868
#> .. ..$ : num [1:3] -371 149 876
#> .. ..$ : num [1:3] -198.4 65.7 841.3
#> .. ..$ : num [1:3] -194 204 1265
#> .. ..$ : num [1:3] -162 208 1115
#> .. ..$ : num [1:3] -389 184 1133
#> .. ..$ : num [1:3] -326 193 1350
#> .. ..$ : num [1:3] -373 63 1193
#> .. ..$ : num [1:3] -143 233 1437
#> .. ..$ : num [1:3] -212 272 1451
#> .. ..$ : num [1:3] -205 122 1447
#> .. ..$ : num [1:3] -138 171 1436
#> .. ..$ : num [1:3] -242 369 747
#> .. ..$ : num [1:3] -163 376 548
#> .. ..$ : num [1:3] -114 350 444
#> .. ..$ : num [1:3] -86.3 236.8 430.7
#> .. ..$ : num [1:3] -96 356 379
#> .. ..$ : num [1:3] -33.1 314.7 383.2
#> .. ..$ : num [1:3] -63.2 369.3 273.2
#> .. ..$ : num [1:3] 33.5 336.3 80.4
#> .. ..$ : num [1:3] 52 260 114
#> .. ..$ : num [1:3] 14.5 283.2 26
#> .. ..$ : num [1:3] 177 288 119
#> .. ..$ : num [1:3] 143.6 366.4 86.5
#> .. ..$ : num [1:3] -278.1 12.1 751.7
#> .. ..$ : num [1:3] -299.2 19.2 625.6
#> .. ..$ : num [1:3] -379.2 61.9 431.5
#> .. ..$ : num [1:3] -373 168 419
#> .. ..$ : num [1:3] -429 58 377
#> .. ..$ : num [1:3] -372 104 350
#> .. ..$ : num [1:3] -507.4 83.4 200.1
#> .. ..$ : num [1:3] -553.4 111.7 81.8
#> .. ..$ : num [1:3] -514.8 191.4 92.1
#> .. ..$ : num [1:3] -605 165.3 56.6
#> .. ..$ : num [1:3] -416.1 162 23.9
#> .. ..$ : num [1:3] -469 71.4 18
#> .. ..$ : num [1:3] -445 497 727
#> .. ..$ : num [1:3] -366 457 684
#> .. ..$ : num [1:3] -406 498 799
#> .. ..$ : num [1:3] -357 444 780
#> .. ..$ : num [1:3] -361 481 924
#> .. ..$ : num [1:3] -367 450 1013
#> .. ..$ : num [1:3] -387 369 991
#> .. ..$ : num [1:3] -339 435 1104
#> .. ..$ : num [1:3] -19.1 -101.5 770.6
#> .. ..$ : num [1:3] 50.3 -38 804.8
#> .. ..$ : num [1:3] -52.6 -103.7 841.1
#> .. ..$ : num [1:3] -24.9 -31.8 855.6
#> .. ..$ : num [1:3] -92.1 -96.2 910.4
#> .. ..$ : num [1:3] -200.1 -84.8 1014
#> .. ..$ : num [1:3] -233.8 -15.4 973.4
#> .. ..$ : num [1:3] -210 -49 1128
#> .. ..$ : num [1:3] -286 372 1290
#> .. ..$ : num [1:3] -233.1 21.6 1291.2
#> ..$ :List of 55
#> .. ..$ : num [1:3] -190 307 840
#> .. ..$ : num [1:3] -368 240 867
#> .. ..$ : num [1:3] -364 150 875
#> .. ..$ : num [1:3] -190.7 66.1 840.3
#> .. ..$ : num [1:3] -187 205 1263
#> .. ..$ : num [1:3] -154 208 1114
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