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Búsqueda difusa (fuzzy) de términos médicos CIE-10

Source: R/cie-search.R
cie_search.Rd

Busca en descripciones CIE-10 usando múltiples estrategias:

  1. Expansión de siglas médicas (IAM, TBC, DM, etc.)

  2. Búsqueda exacta por subcadena (más rápida)

  3. Búsqueda fuzzy con Jaro-Winkler (tolera typos)

Usage

cie_search(
  text,
  threshold = 0.7,
  max_results = 50,
  field = c("descripcion", "inclusion"),
  only_fuzzy = FALSE,
  verbose = TRUE,
  include_uso_cl = FALSE,
  only_uso_cl = FALSE,
  texto = lifecycle::deprecated(),
  campo = lifecycle::deprecated(),
  solo_fuzzy = lifecycle::deprecated()
)

Arguments

text

String término médico en español o sigla (ej. "diabetes", "IAM", "TBC")

threshold

Numeric entre 0 y 1, umbral similitud Jaro-Winkler (default 0.70)

max_results

Integer, máximo resultados a retornar (default 50)

field

Character, campo búsqueda ("descripcion" o "inclusion")

only_fuzzy

Logical, usar solo búsqueda fuzzy sin búsqueda exacta (default FALSE)

verbose

Logical, mostrar mensajes informativos (default TRUE). Usar FALSE en scripts.

include_uso_cl

Logical, incluir columna uso_cl en el output (default FALSE). El default difiere de cie_lookup() (TRUE) para preservar el contrato histórico de cada función. Valores posibles: "principal", "legado", "causa_externa", "etiologico", "causa_externa | principal".

only_uso_cl

Logical, filtrar a códigos vigentes de uso clínico en Chile (default FALSE). Cuando es TRUE, excluye los códigos con uso_cl == "legado".

texto

[Deprecated] Use text.

campo

[Deprecated] Use field.

solo_fuzzy

[Deprecated] Use only_fuzzy.

Value

tibble ordenado por score descendente (1.0 = coincidencia exacta). Si el text corresponde a una sigla médica, se expande automáticamente antes de buscar.

Details

La búsqueda es tolerante a tildes: "neumonia" (sin tilde) encuentra "neumonía" (con tilde) en el catálogo. Soporta siglas médicas comunes: "IAM" busca "infarto agudo miocardio".

See also

cie_lookup(), cie_short(), cie10_sql()

Other search: cie_describe(), cie_guia_busqueda(), cie_guide(), cie_lookup()

Examples

# Búsqueda básica
cie_search("diabetes")
#> # A tibble: 50 × 4
#>    codigo descripcion                                            score categoria
#>    <chr>  <chr>                                                  <dbl> <chr>    
#>  1 E10    Diabetes mellitus insulinodependiente                      1 E10 DIAB…
#>  2 E10.0  Diabetes mellitus tipo 1 con coma                          1 E10 DIAB…
#>  3 E10.1  Diabetes mellitus tipo 1 con cetoacidosis                  1 E10 DIAB…
#>  4 E10.2  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones renales        1 E10 DIAB…
#>  5 E10.3  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones oftálmicas     1 E10 DIAB…
#>  6 E10.4  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones neurológi…     1 E10 DIAB…
#>  7 E10.5  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones  circulat…     1 E10 DIAB…
#>  8 E10.6  Diabetes mellitus tipo 1 con otras complicaciones esp…     1 E10 DIAB…
#>  9 E10.7  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones múltiples      1 E10 DIAB…
#> 10 E10.8  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones no especi…     1 E10 DIAB…
#> # ℹ 40 more rows

cie_search("neumonia")
#> # A tibble: 50 × 4
#>    codigo descripcion                                            score categoria
#>    <chr>  <chr>                                                  <dbl> <chr>    
#>  1 B01.2  Neumonía debida a varicela (J17.1*)                        1 B01 VARI…
#>  2 B05.2  Sarampión complicado con neumonía (J17.1*)                 1 B05 SARA…
#>  3 B20.6  Enfermedad por VIH, resultante en neumonía por Pneumo…     1 B20 ENFE…
#>  4 J10.0  Influenza con neumonía, debida a otro virus de la inf…     1 J10 INFL…
#>  5 J11.0  Influenza con neumonía, virus no identificado              1 J11 INFL…
#>  6 J12    Neumonía viral, no clasificada en otra parte               1 J12 NEUM…
#>  7 J12.0  Neumonía debida a adenovirus                               1 J12 NEUM…
#>  8 J12.1  Neumonía debida a virus sincitial respiratorio             1 J12 NEUM…
#>  9 J12.2  Neumonía debida a virus parainfluenza                      1 J12 NEUM…
#> 10 J12.3  Neumonía por metapneumovirus humano                        1 J12 NEUM…
#> # ℹ 40 more rows

# Búsqueda por siglas médicas
cie_search("IAM")
#> ℹ Sigla detectada: "IAM" -> "infarto agudo miocardio"
#> # A tibble: 50 × 4
#>    codigo descripcion                                            score categoria
#>    <chr>  <chr>                                                  <dbl> <chr>    
#>  1 I21    Infarto agudo del miocardio                                1 I21 INFA…
#>  2 I21.0  Infarto transmural agudo del miocardio de la pared an…     1 I21 INFA…
#>  3 I21.1  Infarto transmural agudo del miocardio de la pared in…     1 I21 INFA…
#>  4 I21.2  Infarto agudo transmural del miocardio de otros sitios     1 I21 INFA…
#>  5 I21.3  Infarto transmural agudo del miocardio, de sitio no e…     1 I21 INFA…
#>  6 I21.4  Infarto subendocárdico agudo del miocardio                 1 I21 INFA…
#>  7 I21.9  Infarto agudo del miocardio, sin otra especificación       1 I21 INFA…
#>  8 I23    Ciertas complicaciones presentes posteriores al infar…     1 I23 CIER…
#>  9 I23.0  Hemopericardio como complicación presente posterior a…     1 I23 CIER…
#> 10 I23.3  Ruptura de la pared cardíaca sin hemopericardio como …     1 I23 CIER…
#> # ℹ 40 more rows
cie_search("DM2")
#> ℹ Sigla detectada: "DM2" -> "diabetes mellitus tipo 2"
#> # A tibble: 11 × 4
#>    codigo descripcion                                            score categoria
#>    <chr>  <chr>                                                  <dbl> <chr>    
#>  1 E11.0  Diabetes mellitus tipo 2 con coma                          1 E11 DIAB…
#>  2 E11.1  Diabetes mellitus tipo 2 con cetoacidosis                  1 E11 DIAB…
#>  3 E11.2  Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones renales        1 E11 DIAB…
#>  4 E11.3  Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones oftálmicas     1 E11 DIAB…
#>  5 E11.4  Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones neurológi…     1 E11 DIAB…
#>  6 E11.5  Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones  circulat…     1 E11 DIAB…
#>  7 E11.6  Diabetes mellitus tipo 2 con otras complicaciones  es…     1 E11 DIAB…
#>  8 E11.7  Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones múltiples      1 E11 DIAB…
#>  9 E11.8  Diabetes mellitus tipo 2 con complicaciones no especi…     1 E11 DIAB…
#> 10 E11.9  Diabetes mellitus tipo 2 sin complicaciones                1 E11 DIAB…
#> 11 O24.1  Diabetes mellitus tipo 2 preexistente                      1 O24 DIAB…

# Tolerante a tildes y typos
cie_search("diabetis")
#> # A tibble: 50 × 4
#>    codigo descripcion                                            score categoria
#>    <chr>  <chr>                                                  <dbl> <chr>    
#>  1 E10    Diabetes mellitus insulinodependiente                  0.917 E10 DIAB…
#>  2 E10.0  Diabetes mellitus tipo 1 con coma                      0.917 E10 DIAB…
#>  3 E10.1  Diabetes mellitus tipo 1 con cetoacidosis              0.917 E10 DIAB…
#>  4 E10.2  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones renales    0.917 E10 DIAB…
#>  5 E10.3  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones oftálmicas 0.917 E10 DIAB…
#>  6 E10.4  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones neurológi… 0.917 E10 DIAB…
#>  7 E10.5  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones  circulat… 0.917 E10 DIAB…
#>  8 E10.6  Diabetes mellitus tipo 1 con otras complicaciones esp… 0.917 E10 DIAB…
#>  9 E10.7  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones múltiples  0.917 E10 DIAB…
#> 10 E10.8  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones no especi… 0.917 E10 DIAB…
#> # ℹ 40 more rows

# Buscar en inclusiones
cie_search("bacteriana", field = "inclusion")
#> ✖ Sin coincidencias >= threshold 0.7
#> # A tibble: 0 × 5
#> # ℹ 5 variables: codigo <chr>, descripcion <chr>, score <dbl>, categoria <chr>,
#> #   inclusion <chr>
# Filtrar a códigos vigentes Chile (excluye 'legado')
cie_search("diabetes", only_uso_cl = TRUE)
#> # A tibble: 50 × 4
#>    codigo descripcion                                            score categoria
#>    <chr>  <chr>                                                  <dbl> <chr>    
#>  1 E10.0  Diabetes mellitus tipo 1 con coma                          1 E10 DIAB…
#>  2 E10.1  Diabetes mellitus tipo 1 con cetoacidosis                  1 E10 DIAB…
#>  3 E10.2  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones renales        1 E10 DIAB…
#>  4 E10.3  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones oftálmicas     1 E10 DIAB…
#>  5 E10.4  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones neurológi…     1 E10 DIAB…
#>  6 E10.5  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones  circulat…     1 E10 DIAB…
#>  7 E10.6  Diabetes mellitus tipo 1 con otras complicaciones esp…     1 E10 DIAB…
#>  8 E10.7  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones múltiples      1 E10 DIAB…
#>  9 E10.8  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones no especi…     1 E10 DIAB…
#> 10 E10.9  Diabetes mellitus tipo 1 sin complicaciones                1 E10 DIAB…
#> # ℹ 40 more rows
# Mostrar la columna uso_cl en el output
cie_search("diabetes", include_uso_cl = TRUE)
#> # A tibble: 50 × 5
#>    codigo descripcion                                     score categoria uso_cl
#>    <chr>  <chr>                                           <dbl> <chr>     <chr> 
#>  1 E10    Diabetes mellitus insulinodependiente               1 E10 DIAB… legado
#>  2 E10.0  Diabetes mellitus tipo 1 con coma                   1 E10 DIAB… princ…
#>  3 E10.1  Diabetes mellitus tipo 1 con cetoacidosis           1 E10 DIAB… princ…
#>  4 E10.2  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones re…     1 E10 DIAB… princ…
#>  5 E10.3  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones of…     1 E10 DIAB… princ…
#>  6 E10.4  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones ne…     1 E10 DIAB… princ…
#>  7 E10.5  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones  c…     1 E10 DIAB… princ…
#>  8 E10.6  Diabetes mellitus tipo 1 con otras complicacio…     1 E10 DIAB… princ…
#>  9 E10.7  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones mú…     1 E10 DIAB… princ…
#> 10 E10.8  Diabetes mellitus tipo 1 con complicaciones no…     1 E10 DIAB… princ…
#> # ℹ 40 more rows