aggregates original data from a given study
Arguments
- study
character, the name of the study you want to aggregate the dta from
- na.rm
logical, whether or not to exclude odorants that were not measured in the study
Author
Daniel Münch <daniel.muench@uni-konstanz.de>
Examples
# load data
library(DoOR.data)
load_door_data(nointeraction = TRUE)
# get all recordings from the Hallem.2004.EN data set
get_dataset("Hallem.2004.EN", na.rm = TRUE)
#> Class Name InChIKey CID
#> 1 <NA> sfr SFR SFR
#> 4 amine putrescine KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N 1045
#> 12 O ring gamma-hexalactone JBFHTYHTHYHCDJ-UHFFFAOYSA-N 12756
#> 31 sulfid 3-methylthio-1-propanol CZUGFKJYCPYHHV-UHFFFAOYSA-N 10448
#> 34 sulfid propanethiol SUVIGLJNEAMWEG-UHFFFAOYSA-N 7848
#> 36 terpene alpha-pinene GRWFGVWFFZKLTI-UHFFFAOYSA-N 6654
#> 44 terpene geranyl acetate HIGQPQRQIQDZMP-DHZHZOJOSA-N 1549026
#> 46 terpene geraniol GLZPCOQZEFWAFX-JXMROGBWSA-N 637566
#> 48 terpene linalool CDOSHBSSFJOMGT-UHFFFAOYSA-N 6549
#> 55 terpene citral WTEVQBCEXWBHNA-JXMROGBWSA-N 638011
#> 74 aldehyde E2-hexenal MBDOYVRWFFCFHM-SNAWJCMRSA-N 5281168
#> 75 O ring furfural HYBBIBNJHNGZAN-UHFFFAOYSA-N 7362
#> 77 aldehyde octanal NUJGJRNETVAIRJ-UHFFFAOYSA-N 454
#> 83 ketone acetone CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 180
#> 85 ketone 2-pentanone XNLICIUVMPYHGG-UHFFFAOYSA-N 7895
#> 86 ketone 2-heptanone CATSNJVOTSVZJV-UHFFFAOYSA-N 8051
#> 88 ketone 2,3-butanedione QSJXEFYPDANLFS-UHFFFAOYSA-N 650
#> 89 ketone 3-hydroxy-2-butanone ROWKJAVDOGWPAT-UHFFFAOYSA-N 179
#> 93 ketone cyclohexanone JHIVVAPYMSGYDF-UHFFFAOYSA-N 7967
#> 94 ketone 2-octanone ZPVFWPFBNIEHGJ-UHFFFAOYSA-N 8093
#> 98 arom benzyl alcohol WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N 244
#> 99 arom methyl salicylate OSWPMRLSEDHDFF-UHFFFAOYSA-N 4133
#> 103 arom benzaldehyde HUMNYLRZRPPJDN-UHFFFAOYSA-N 240
#> 104 arom phenylacetaldehyde DTUQWGWMVIHBKE-UHFFFAOYSA-N 998
#> 105 arom acetophenone KWOLFJPFCHCOCG-UHFFFAOYSA-N 7410
#> 107 arom 2-methylphenol QWVGKYWNOKOFNN-UHFFFAOYSA-N 335
#> 120 arom 4-methylphenol IWDCLRJOBJJRNH-UHFFFAOYSA-N 2879
#> 121 arom 4-ethylphenol HXDOZKJGKXYMEW-UHFFFAOYSA-N 31242
#> 126 arom benzyl acetate QUKGYYKBILRGFE-UHFFFAOYSA-N 8785
#> 127 arom 4-propylphenol KLSLBUSXWBJMEC-UHFFFAOYSA-N 12580
#> 128 arom 3-methylphenol RLSSMJSEOOYNOY-UHFFFAOYSA-N 342
#> 135 alcohol 1-butanol LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 263
#> 137 alcohol 1-hexanol ZSIAUFGUXNUGDI-UHFFFAOYSA-N 8103
#> 138 alcohol 1-octanol KBPLFHHGFOOTCA-UHFFFAOYSA-N 957
#> 144 alcohol 1-octen-3-ol VSMOENVRRABVKN-UHFFFAOYSA-N 18827
#> 145 alcohol E2-hexenol ZCHHRLHTBGRGOT-SNAWJCMRSA-N 5318042
#> 150 alcohol 2,3-butanediol OWBTYPJTUOEWEK-UHFFFAOYSA-N 262
#> 151 alcohol cyclohexanol HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N 7966
#> 155 alcohol 3-octanol NMRPBPVERJPACX-UHFFFAOYSA-N 11527
#> 156 alcohol 1-nonanol ZWRUINPWMLAQRD-UHFFFAOYSA-N 8914
#> 164 ester ethyl acetate XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 8857
#> 166 ester butyl acetate DKPFZGUDAPQIHT-UHFFFAOYSA-N 31272
#> 167 ester pentyl acetate PGMYKACGEOXYJE-UHFFFAOYSA-N 12348
#> 170 ester isopentyl acetate MLFHJEHSLIIPHL-UHFFFAOYSA-N 31276
#> 171 ester E2-hexenyl acetate HRHOWZHRCRZVCU-WAYWQWQTSA-N 2733294
#> 173 ester ethyl butyrate OBNCKNCVKJNDBV-UHFFFAOYSA-N 7762
#> 175 ester ethyl 3-hydroxybutyrate OMSUIQOIVADKIM-UHFFFAOYSA-N 62572
#> 176 ester ethyl propionate FKRCODPIKNYEAC-UHFFFAOYSA-N 7749
#> 179 ester ethyl hexanoate SHZIWNPUGXLXDT-UHFFFAOYSA-N 31265
#> 192 N ring indole SIKJAQJRHWYJAI-UHFFFAOYSA-N 798
#> 199 ester ethyl 2-methylbutanoate HCRBXQFHJMCTLF-UHFFFAOYSA-N 24020
#> 201 ester ethyl pentanoate ICMAFTSLXCXHRK-UHFFFAOYSA-N 10882
#> 221 other oil solvent solvent
#> 225 other carbon dioxide CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 280
#> 227 N ring pyrrolidine RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N 31268
#> 666 <NA> (R)-(+)-citronellal NEHNMFOYXAPHSD-SNVBAGLBSA-N 75427
#> CAS Or2a Or7a Or9a Or10a Or19a Or22a Or23a Or33b
#> 1 SFR NA 15.592 NA NA NA 6.186 NA 0.000
#> 4 110-60-1 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 12 695-06-7 NA NA NA NA NA NA 24.167 NA
#> 31 505-10-2 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 34 107-03-9 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 36 80-56-8 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 44 105-87-3 16.667 44.833 29.167 19.333 54.167 27.333 17.167 -1.583
#> 46 106-24-1 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 48 78-70-6 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 55 5392-40-5 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 74 6728-26-3 21.167 229.500 46.667 11.667 39.333 28.000 63.333 -6.083
#> 75 98-01-1 35.167 NA NA NA NA NA 24.333 NA
#> 77 124-13-0 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 83 67-64-1 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 85 107-87-9 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 86 110-43-0 52.333 0.667 98.833 10.500 153.833 82.500 54.167 -7.333
#> 88 431-03-8 21.333 53.167 152.500 31.500 52.167 80.833 32.000 -4.167
#> 89 513-86-0 65.000 NA 203.000 NA NA NA NA NA
#> 93 108-94-1 41.500 NA NA NA NA NA 53.500 NA
#> 94 111-13-7 NA NA NA NA 192.000 NA NA NA
#> 98 100-51-6 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 99 119-36-8 20.000 14.833 25.000 249.500 61.667 17.500 16.000 -8.083
#> 103 100-52-7 NA 206.333 NA 70.833 NA NA NA NA
#> 104 122-78-1 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 105 98-86-2 NA NA NA 204.833 NA NA NA NA
#> 107 95-48-7 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 120 106-44-5 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 121 123-07-9 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 126 140-11-4 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 127 645-56-7 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 128 108-39-4 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 135 71-36-3 NA 205.167 NA NA NA NA NA NA
#> 137 111-27-3 41.500 113.167 95.833 5.500 152.500 68.167 57.167 -11.417
#> 138 111-87-5 NA NA NA NA 136.500 NA NA NA
#> 144 3391-86-4 35.667 30.667 50.667 2.000 171.333 108.333 33.333 -14.917
#> 145 928-95-0 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 150 513-85-9 NA NA 189.333 NA NA NA NA NA
#> 151 108-93-0 51.000 NA NA NA NA NA 42.833 NA
#> 155 589-98-0 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 156 143-08-8 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 164 141-78-6 17.833 35.833 71.833 24.000 61.000 59.667 17.000 -3.583
#> 166 123-86-4 NA NA NA NA 125.500 124.833 NA -15.500
#> 167 628-63-7 59.500 10.500 87.833 11.500 150.167 156.500 45.500 -13.167
#> 170 123-92-2 NA 1.500 NA 116.333 162.833 144.167 NA NA
#> 171 2497-18-9 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 173 105-54-4 20.333 10.833 121.167 25.000 93.333 168.000 24.167 5.000
#> 175 5405-41-4 NA NA NA NA NA NA NA -17.417
#> 176 105-37-3 NA NA 80.000 NA NA 124.167 NA 36.917
#> 179 123-66-0 NA NA NA NA NA NA NA -7.167
#> 192 120-72-9 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 199 7452-79-1 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 201 539-82-2 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 221 solvent 16.333 27.667 11.333 17.000 16.000 10.000 8.833 0.500
#> 225 124-38-9 17.167 26.000 8.167 19.500 12.667 6.000 14.667 2.417
#> 227 123-75-1 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 666 106-23-0 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> Or35a Or43a Or43b Or47a Or47b Or49b Or59b Or65a Or67a
#> 1 NA NA NA NA 73.076 NA 7.008 NA NA
#> 4 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 12 NA NA NA NA 40.743 NA NA NA NA
#> 31 NA NA NA 231.167 NA NA NA NA NA
#> 34 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 36 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 44 21.667 27.500 21.000 6.333 56.243 10.167 25.921 19.833 29.500
#> 46 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 48 NA NA NA NA NA NA -2.079 NA NA
#> 55 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 74 200.167 84.500 103.667 39.500 64.076 9.833 20.087 14.667 71.500
#> 75 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 77 176.000 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 83 NA NA NA NA NA NA 84.921 NA NA
#> 85 100.333 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 86 116.833 71.833 75.167 182.833 33.493 16.000 26.754 39.500 111.000
#> 88 69.000 46.667 75.667 37.167 49.826 24.667 119.504 35.000 42.667
#> 89 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 93 NA 127.000 NA NA 64.493 NA NA NA NA
#> 94 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 98 NA 83.167 NA NA NA NA NA 16.333 NA
#> 99 23.667 55.333 18.500 0.167 72.993 27.000 4.504 5.833 25.333
#> 103 NA 72.667 NA NA NA NA NA 9.833 NA
#> 104 NA 35.667 NA NA NA NA NA NA NA
#> 105 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 107 NA NA NA NA NA 175.833 NA NA NA
#> 120 NA NA NA NA NA 67.500 NA NA NA
#> 121 NA NA NA NA NA 51.167 NA NA NA
#> 126 NA NA NA NA NA NA NA 25.667 NA
#> 127 NA NA NA NA NA 33.833 NA NA NA
#> 128 NA NA NA NA NA 102.333 NA NA NA
#> 135 222.000 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 137 216.000 149.500 125.333 60.833 8.410 20.667 30.087 24.167 92.000
#> 138 NA 23.667 NA NA NA NA NA NA NA
#> 144 209.667 112.667 54.167 84.667 25.743 13.333 16.004 21.000 98.333
#> 145 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 150 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 151 NA 139.000 NA NA 38.743 NA NA NA NA
#> 155 NA NA NA NA NA NA NA NA 110.167
#> 156 163.667 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 164 33.333 30.333 178.167 115.000 52.826 17.833 121.087 17.833 42.667
#> 166 NA NA 202.667 NA NA NA NA NA NA
#> 167 201.500 52.667 112.833 255.833 26.160 15.000 36.421 36.167 130.000
#> 170 NA NA NA NA NA NA NA NA 122.000
#> 171 NA NA NA NA NA NA NA NA 46.333
#> 173 101.167 62.833 210.667 84.000 41.576 9.333 26.421 16.333 101.000
#> 175 185.500 NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 176 NA NA NA NA NA NA 66.171 NA 55.667
#> 179 NA NA 49.500 NA NA NA NA NA 154.833
#> 192 NA NA NA NA NA NA NA 7.167 NA
#> 199 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> 201 NA NA 164.667 NA NA NA NA NA NA
#> 221 26.833 25.167 7.667 13.333 72.576 7.333 10.921 13.167 15.833
#> 225 20.000 23.500 6.333 15.333 71.826 7.833 10.587 17.333 18.500
#> 227 NA NA NA NA NA NA NA 59.167 NA
#> 666 NA NA NA NA NA NA NA NA NA
#> Or67c Or82a Or85a Or85b Or85f Or88a Or98a
#> 1 NA NA NA NA NA 0.000 NA
#> 4 NA NA NA 79.500 NA NA NA
#> 12 NA NA NA NA 59.000 NA NA
#> 31 NA NA NA NA NA NA NA
#> 34 NA NA NA 116.667 NA NA NA
#> 36 NA 19.500 NA NA NA NA NA
#> 44 5.000 211.667 10.833 64.333 8.000 1.333 81.167
#> 46 NA 30.333 NA NA NA NA NA
#> 48 NA 34.545 NA NA NA NA 159.333
#> 55 NA 71.667 NA NA NA NA NA
#> 74 58.833 12.333 30.500 186.500 35.333 -5.083 45.833
#> 75 NA NA NA NA 56.333 NA NA
#> 77 NA NA NA NA NA NA NA
#> 83 NA NA NA NA NA NA NA
#> 85 NA NA NA NA NA NA NA
#> 86 53.000 40.000 42.833 238.667 54.000 -8.583 220.833
#> 88 47.667 34.500 36.667 175.833 31.500 5.583 44.667
#> 89 NA NA NA NA NA NA NA
#> 93 NA NA NA NA NA NA NA
#> 94 NA NA NA NA NA NA NA
#> 98 NA NA NA NA NA NA NA
#> 99 2.333 12.333 6.333 52.167 19.333 -6.500 29.500
#> 103 NA NA NA NA 41.667 NA NA
#> 104 NA NA NA NA NA NA NA
#> 105 NA NA NA NA NA NA NA
#> 107 NA NA NA NA NA NA NA
#> 120 NA NA NA NA NA NA NA
#> 121 NA NA NA NA NA NA NA
#> 126 NA NA NA NA NA NA NA
#> 127 NA NA NA NA NA NA NA
#> 128 NA NA NA NA NA NA NA
#> 135 NA NA NA NA NA NA NA
#> 137 99.167 47.000 141.667 247.000 64.000 -10.583 167.833
#> 138 NA NA NA NA NA NA NA
#> 144 25.167 35.333 45.000 234.167 32.667 -11.750 196.833
#> 145 100.333 NA 141.500 NA NA NA 191.667
#> 150 NA NA NA NA NA NA NA
#> 151 NA NA NA NA 62.167 NA NA
#> 155 NA NA NA 245.000 NA NA NA
#> 156 NA NA NA NA NA NA NA
#> 164 35.167 27.167 56.833 39.333 25.333 -0.500 27.000
#> 166 NA NA NA NA NA NA NA
#> 167 28.167 38.833 34.333 254.667 38.333 -11.917 231.333
#> 170 NA NA NA NA NA NA NA
#> 171 10.667 NA NA NA NA NA NA
#> 173 135.000 33.500 132.167 141.833 30.333 -4.417 113.167
#> 175 54.333 NA NA NA NA NA NA
#> 176 47.000 NA NA NA NA NA 41.833
#> 179 NA NA NA NA NA NA NA
#> 192 NA NA NA NA NA -5.083 NA
#> 199 91.000 NA 58.167 NA NA NA NA
#> 201 NA NA NA NA NA NA NA
#> 221 4.333 13.667 11.000 58.333 4.000 1.250 21.167
#> 225 6.833 13.833 15.000 44.000 4.667 -0.667 45.667
#> 227 NA NA NA NA NA 81.333 NA
#> 666 NA 49.333 NA NA NA NA NA